Le Prof. Ouedraogo dirige le Laboratoire National Référent pour la Surveillance de la Méningite Bactérienne et des Maladies Épidémiques du Burkina Faso, qui collabore étroitement avec le Centre de Contrôle et de Prévention des Maladies (CDC) américain.

Dans le cadre d'Oasis, le Prof. Ouedraogo occupe le rôle de Chercheur Principal au Burkina Faso, où il dirige son équipe dans l'implémentation du projet